Mejores 9 software de facturación para startups en 2025

Estos son los mejores software de facturación para startups:

1. Banktrack
2. Taclia
3. Sage 50
4. Billin
5. Anfix
6. Contasimple
7. FacturaDirecta
8. A3Factura
9. Debitoor

Las startups operan en un entorno donde la velocidad, la escalabilidad y el control financiero marcan la diferencia entre crecer de forma ordenada o perder el rumbo. 

Desde los primeros clientes hasta las primeras rondas de inversión, la facturación es uno de los pilares que sostienen el negocio: permite cobrar a tiempo, evitar errores, cumplir con la normativa y entender la salud financiera real de la empresa.

El problema es que muchas startups comienzan con herramientas improvisadas, hojas de cálculo, procesos manuales o sistemas que no están preparados para escalar. Esto provoca retrasos en los cobros, errores en la facturación, problemas de liquidez y mala visibilidad sobre el negocio.

Por eso hemos preparado esta guía con los mejores software de facturación para startups en 2025.

Los 9 mejores software de facturación para startups en 2025

1. Banktrack

Banktrack es el software de facturación más completo para startups que necesitan mucho más que generar facturas. 

En un entorno donde el cash flow determina la supervivencia del proyecto, Banktrack integra facturación, tesorería, conexión bancaria, conciliación automática, previsiones y paneles financieros diseñados para empresas que crecen rápido.

Por qué Banktrack es el mejor software para startups

Facturación adaptada a modelos de negocio modernos

• facturas recurrentes mensuales o trimestrales
• facturación por suscripción (SaaS, membership, retainers)
• conversión directa de presupuestos en facturas
• recordatorios y cobros automatizados
• envío de facturas con un clic

Control financiero en tiempo real

• visión clara del dinero disponible
• previsión del runway según ingresos, gastos y tendencias
• paneles con MRR, churn, coste por cliente y evolución mensual
• categorización automática de gastos

Conciliación bancaria con cero esfuerzo

• sincronización automática con los bancos
• emparejamiento de pagos de clientes con facturas emitidas
• detección de cobros duplicados o pendientes

Previsión de tesorería

• simulación de escenarios: crecimiento, caída de ventas, nuevas contrataciones
• estimación del runway y proyecciones de liquidez
• alertas cuando se detectan meses futuros con riesgo financiero

Ideal para: startups tecnológicas, SaaS, empresas de suscripción, negocios con rondas de financiación, empresas en crecimiento y equipos que necesitan datos claros para tomar decisiones.

2. Taclia

Taclia es una herramienta sencilla y rápida para startups que están comenzando y necesitan emitir facturas sin complicación. Su enfoque es ofrecer un sistema accesible, intuitivo y fácil de manejar desde cualquier dispositivo.

Características destacadas

• creación de facturas en segundos
• presupuestos convertibles en factura
• aplicación web y móvil
• gestión de clientes y servicios
• interfaz muy ágil

Ideal para: startups en fase temprana, emprendedores individuales o pequeños equipos que buscan simplicidad y rapidez.

3. Sage 50

Sage 50 es una de las soluciones más potentes para startups con ambición de crecer y preparar una estructura sólida desde el primer día. Incorpora facturación, contabilidad, control de inventario y gestión administrativa.

Características destacadas

• facturación completa
• informes financieros avanzados
• gestión contable y fiscal integrada
• escalabilidad para pymes en crecimiento

Ideal para: startups que ya generan cierto volumen de facturas o que necesitan estabilidad y cumplimiento normativo robusto.

4. Billin

Billin destaca por su enfoque claro en la facturación y el control de cobros. Es una herramienta muy valorada en startups que envían muchas facturas pequeñas o recurrentes.

Características destacadas

• envío de facturas con seguimiento
• recordatorios automáticos de cobro
• sistema de gestión del estado de pagos
• interfaz muy simple

Ideal para: startups orientadas a servicios, freelances profesionalizados y empresas que necesitan cobrar rápido.

5. Anfix

Anfix ofrece una solución moderna basada en la nube, con facturación rápida, control de gastos y conexión bancaria. Es especialmente útil para startups que necesitan flexibilidad.

Características destacadas

• facturación desde cualquier dispositivo
• conexión con bancos
• lectura automática de tickets y facturas
• plantillas personalizables

Ideal para: startups de servicios o empresariales que requieren movilidad y automatización básica.

6. Contasimple

Contasimple es una opción ligera para startups que quieren facturación, control fiscal y gestión básica sin complicaciones.

Características destacadas

• creación de facturas y presupuestos
• cálculo automático de impuestos
• control de ingresos y gastos
• plantillas simples y claras

Ideal para: micro-startups y negocios pequeños que buscan cumplir normativa sin añadir complejidad.

7. FacturaDirecta

FacturaDirecta es un software directo, fácil y pensado para quienes necesitan emitir facturas sin complicarse con módulos adicionales.

Características destacadas

• facturas profesionales
• presupuestos y albaranes
• gestión simple de productos y servicios
• control básico de cliente

Ideal para: startups en fase inicial o negocios muy pequeños que valoran la simplicidad.

8. A3Factura

A3Factura es una solución muy robusta dentro del entorno empresarial español. Su punto fuerte es la fiabilidad y el cumplimiento normativo.

Características destacadas

• facturación completa
• automatización administrativa
• integración con asesorías y contabilidad
• buen soporte y estabilidad

Ideal para: startups en crecimiento que buscan profesionalizar su administración rápidamente.

9. Debitoor

Debitoor es una herramienta ligera orientada a autónomos y startups pequeñas que necesitan una solución simple, visual y rápida.

Características destacadas

• creación inmediata de facturas
• presupuestos fáciles
• control básico de gastos
• diseño visual muy intuitivo

Ideal para: emprendedores individuales, negocios unipersonales o startups en fase semilla.

Qué necesita un buen software de facturación para startups

Un negocio tradicional no funciona igual que una startup. Por eso, su software tampoco debe ser el mismo. Estas son las características imprescindibles:

Automatización

Las startups deben evitar tareas repetitivas para centrarse en crecimiento. El software de tesorería debe permitir:

• facturas automáticas
• cobros automatizados
• recordatorios de pago
• procesos sin intervención manual

Integración con otras herramientas

La mayoría de startups usan CRM, herramientas de gestión de proyectos, plataformas de pago, Slack, herramientas de desarrollo o automatizaciones. El software debe integrarse bien con todo.

Facturación recurrente

Las startups SaaS y de servicios requieren:

• facturación mensual automática
• control del churn
• seguimiento del MRR
• análisis de recurrencia

Control del cash flow

Es uno de los mayores motivos por los que mueren startups. Necesitan un software que:

• conecte con los bancos
• calcule runway
• haga previsiones de tesorería
• detecte riesgos financieros

Escalabilidad

Debe soportar que una startup pase de emitir 10 facturas al mes a 300 sin necesidad de migrar de sistema.

7 Tendencias en facturación para startups en 2025–2027

El ecosistema startup evoluciona rápido y la forma de facturar también. Las empresas jóvenes necesitan velocidad, integración, previsión y automatización. Estas son las tendencias que dominarán los próximos años.

1. Automatización completa del ciclo de facturación

La facturación dejará de ser un proceso manual. Las startups usarán sistemas capaces de:

• generar facturas automáticamente según el servicio contratado
• enviar recordatorios sin intervención humana
• registrar cobros en cuanto el banco los detecte
• actualizar métricas financieras en tiempo real

La automatización será imprescindible para reducir errores, escalar sin aumentar personal administrativo y evitar retrasos en los cobros.

2. Facturación integrada con CRM y plataformas de ventas

Las startups que venden online, por suscripción o mediante equipos de ventas necesitan que todos los sistemas estén conectados. La tendencia es clara:

• el CRM creará automáticamente oportunidades → contratos → facturas
• la facturación reflejará cambios en clientes, upgrades y downgrades
• los equipos de ventas verán si un cliente ha pagado o no
• los informes unirán ventas + facturación + cobros

Esto elimina duplicidades y construye un flujo comercial-financiero coherente.

3. Conexión total con la banca europea (Open Banking)

El Open Banking ya permite sincronizar cuentas, pero la tendencia va mucho más lejos:

• conciliación bancaria instantánea
• detección automática de cobros y devoluciones
• alertas personalizadas cuando un cliente paga
• previsiones de liquidez basadas en movimientos bancarios reales

Para startups con crecimiento acelerado, esta conexión es fundamental para controlar su runway financiero.

4. Paneles financieros orientados a métricas SaaS

Las empresas de suscripción (SaaS, membership, marketplaces, plataformas digitales) necesitan un tipo de análisis distinto al de las pymes tradicionales. Por eso los software comienzan a integrar paneles nativos para:

• MRR (Monthly Recurring Revenue)
• ARR (Annual Recurring Revenue)
• Churn mensual
• LTV (Lifetime Value)
• CAC (Customer Acquisition Cost)
• Cohortes de clientes
• Crecimiento real del “net revenue”

La facturación y el análisis ya no serán módulos separados: convivirán en el mismo sistema.

5. Adopción universal de la factura electrónica y Verifactu

La entrada en vigor de la factura electrónica obligatoria y del sistema Verifactu marcará un antes y un después. Todas las startups deberán:

• emitir facturas electrónicas certificadas
• cumplir requisitos de anti-fraude
• reportar facturas en tiempo real
• garantizar trazabilidad y registro seguro

Esto obligará al 100 % de software del mercado a adaptarse y automatizar procesos que antes requerían intervención humana.

6. Inteligencia artificial para prever ingresos, churn y liquidez

La IA dejará de ser un “extra” para convertirse en la norma:

• predicción de ingresos a 3–12 meses
• estimación del churn según comportamiento del cliente
• análisis de picos de gasto y alertas inteligentes
• previsión de tensiones de tesorería
• recomendaciones automáticas para mejorar el margen

Las startups con crecimiento rápido dependerán de estas predicciones para tomar decisiones estratégicas.

7. Análisis financiero automático sin interventor humano

El análisis financiero pasará a ser automático. En lugar de depender de un controller o un analista manual, los software proporcionarán:

• desgloses de ingresos por cliente, país o producto
• informes mensuales automáticos
• alertas cuando una métrica clave cae
• evaluaciones de rentabilidad por proyecto
• simulación de escenarios ante decisiones estratégicas

Las startups podrán tomar decisiones informadas sin necesidad de montar un equipo financiero completo desde el principio.

Conclusión

El software de facturación adecuado no solo ayuda a emitir facturas. En una startup marca la diferencia entre tener liquidez, crecer con orden y presentar métricas claras a inversores, o caer en errores administrativos y falta de control financiero.

Por eso, entre todas las alternativas, Banktrack destaca como la herramienta más completa del mercado: facturación profesional, paneles financieros, tesorería en tiempo real, previsiones de liquidez y control total de los ingresos y gastos. Es una plataforma diseñada para el ritmo acelerado y las necesidades reales de las startups modernas.